—- —— —— — —- — — — — —- —— —- —— – —- —- —— – —- —- – —- – – — —- —- – —- — — — —- — —- — —- — — —- — —- —- — —- — — — —- — —- — — — —- —- — — — — — — — — — — — — —- —- — — — — — — —- —- — — — — — — — —- — — — — — —- — — — — — — — —- —- — — — — — — — —- —- — — — — — — — — — – —- — —- — —- — — — ——- – — – — — — — — — — — – — – — — — — —- — — —— — — – — — — — —- — — — —— — — — — — – – — — – — — —- — — — —— — — – – – — — — — —- — — — — —- —— — — – — — — – – — — — — ——- —- —— — —— — — — — — — — – — — —— — — —- — — – — —— — — — — — – – — — — —— — — — —— — — – — — — —- — — — — — — —— — —— — —- — – — — – — — — — — —– – — – – — —- – – — — — — — — – — —- — —— – — — — — — — — —– – – — — — — – – — — — — — — — – – – — —— – – — — —– – – — — — — — — ——– — — — – — — — — — ——- – — —— – — – — ——- – — ——– — — — — —– — – – — – — — ——- — — — — —- — — — — — — — — ——– — — ——- — – — — — ——- – — ——– — — —— – ——- – — — — — ——– — — ——- – — —– – – — — — ——– — — — — – — – — – ——- – — — — ——– — —— – — — — —- – — — — — ——– ——- – — — – — — —– – – — — —– — — — — – — – — — — —- – — — — —- — — – — — — – – – — — —— — — — — — — — — – – — — —— —– — — — — —- — — — – – – — — —— — —– — — — — —— – — —– — — — — — – – – — —– — — — — —— —– — – — — – — — — — — – – – — — – — — —— — – — — — —– – — — — — — — – — — — – — – ——— — —– – — — —— — – — — — — – – — — —— — — ——— —— – — — — ———- — —- — – —— – — —- —– — ———- — — – —— – – — — ———- —— – — —- — — — —- —— — ———- —— – — — — — — — – ———- —— – — — — – — — – ———- — — – —— – — — — – — ———- — — — – —- — – — — — – — —— — – — —- — — — — — — — – — —— — — —- – — — — – — — — – ——— — —- – — — — — – — —— – – — — — – —- – – – ———- — — – ——— – — — – — — – — —- — ——- — — —- — — – — — – — — – – — — — – — – — — – – – — – — – — – — — – – — — — – — – — — – – – — — – — – – — – — – — – — – — – – — — — – — – — — — – — —— — – — – — – — —– — — – ———- ——————www.TAPI-2 biological activity nature.com/scientificreports/Figure 2. Mastitis isolates are more closely related to each other, on average, than would be expected by chance. Panel A shows a phylogenetic tree for 533 phylogroup A genomes, constructed from the concatenated sequence of 520 non-recombining genes as estimated by maximum likelihood. For clarity, bootstrap values have been removed. Labels are coloured according to country of origin (Belgium = brown, Finland = green, France = blue, Germany = SIS3 clinical trials purple, Israel = gold, UK = red).—- —— —— — —- — — — — —- —— —- —— – —- —- —— – —- —- – —- – – — —- —- – —- — — — —- — —- — —- — — —- — —- —- — —- — — — —- — —- — — — —- —- — — — — — — — — — — — — —- —- — — — — — — —- —- — — — — — — — —- — — — — — —- — — — — — — — —- —- — — — — — — — —- —- — — — — — — — — — – —- — —- — —- — — — ——- – — – — — — — — — — — – — – — — — — —- — — —— — — – — — — — —- — — — —— — — — — — – – — — – — — —- — — — —— — — – – – — — — — —- — — — — —- —— — — – — — — – – — — — — ——- —- —— — —— — — — — — — — – — — —— — — —- — — – — —— — — — — — – – — — — —— — — — —— — — – — — — —- — — — — — — —— — —— — —- — – — — – — — — — — —– – — – – — —- – – — — — — — — – — —- — —— – — — — — — — — —– – – — — — — – – — — — — — — — – – – — —— – – — — —– – – — — — — — — ——– — — — – — — — — — ——- – — —— – — – — ——- – — ——– — — — — —– — – – — – — — ——- — — — — —- — — — — — — — — ——– — — ——- — – — — — ——- – — ——– — — —— – ——- – — — — — ——– — — ——- – — —– – – — — — ——– — — — — – — – — – ——- – — — — ——– — —— – — — — —- – — — — — ——– ——- – — — – — — —– – – — — —– — — — — – — – — — — —- – — — — —- — — – — — — – – – — — —— — — — — — — — — – – — — —— —– — — — — —- — — — – – – — — —— — —– — — — — —— – — —– — — — — — – – – — —– — — — — —— —– — – — — – — — — — — – – – — — – — — —— — – — — — —– – — — — — — — – — — — – — – ——— — —– – — — —— — – — — — — – – — — —— — — ——— —— – — — — ———- — —- — – —— – — —- —– — ———- — — – —— – – — — ———- —— – — —- — — — —- —— — ———- —— – — — — — — — – ———- —— – — — — – — — – ———- — — – —— – — — — – — ———- — — — – —- — – — — — – — —— — – — —- — — — — — — — – — —— — — —- – — — — – — — — – ——— — —- – — — — — – — —— – – — — — – —- – – – ———- — — – ——— – — — – — — – — —- — ——- — — —- — — – — — – — — – – — — — – — – — — – – – — – — – — – — — – – — — — – — – — — – – – — — – — – – — – — – — – — – — – – — — — – — – — — — – — —— — – — – — – — —– — — – ———- ——————www.nature.com/scientificreports/Figure 2. Mastitis isolates are more closely related to each other, on average, than would be expected by chance. Panel A shows a phylogenetic tree for 533 phylogroup A genomes, constructed from the concatenated sequence of 520 non-recombining genes as estimated by maximum likelihood. For clarity, bootstrap values have been removed. Labels are coloured according to country of origin (Belgium = brown, Finland = green, France = blue, Germany = purple, Israel = gold, UK = red).